Históricamente los primeros habitantes de Borikén (nombre indígena de la isla),  fueron los indios Taínos, una tribu descendiente de los indios Arawak de Venezuela. El idioma escrito del Taíno era en forma de petroglificos o símbolos que se tallaban en piedra y su idioma era Arawak. Su sociedad era comunal y la polígamia era común, estos ya habitaban la isla desde el segundo siglo antes de la era cristiana. Según nuestros historiadores estos provinieron de (Suramérica) las costas de Venezuela, a través de las Antillas Menores. Hay otros historiadores que piensan que estos llegaron de la península de la Florida, en  (Norteamérica)  o de la de Yucatán, en (Centroamérica).

   En aquellas comunidades tribales, que no se conocían la agricultura ni el arte de la cerámica, estos indigenas debieron viajar en rústicas balsas de troncos por razones que hoy se desconocen. Todo parece indicar que prefirieron las zonas costeras para establecer sus pequeñas comunidades con sus (bateyes) Los pocos restos arqueológicos que de ellos se han localizado en Puerto Rico, están Utuado, (parque ceremonial Tibes) en Loíza y en Vieques. Estos indigenas dependian para su subsistencia del recogido de frutos silvestres, de la pesca en ríos y mares y de la cacería menor, especialmente, de los pocos mamíferos y de la amplia diversidad de reptiles y aves que habitaban la isla de Borikén

   Casi toda su cultura y religiosidad son prácticamente desconocidos. Se sabe que tenían algún tipo particular de creencia religiosa. Esto se puede deducir ya que se han encontrado depóstitos funerarios ligados a la tradición arcaica que demuestran que preparaban sus cadáveres y los enterraban en cavernas en posición extendida. Todo ello demuestra la existencia de un ritual mortuorio complejo. Asociados a los restos se han encontrado navajas de pedernal y caracol y morteros de piedra que debieron ser utensilios de uso diario de estas comunidades.

   Todo tiende a indicar que que desde el primer o segundo siglo después de la era cristiana, la isla sintió el arribo de una nueva comunidad indígena: los aruacos. Éstos habían partido del norte de la América del Sur presionados por otras comunidades continentales. Dominaban unas técnicas más complejas que los arcaicos como, la navegación en canoas, la agricultura y la elaboración de la cerámica, entre otras. A aquella economía centrada en la agricultura le correspondía un ordenamiento social y cultural distinto del de los arcaicos.